Türkiye’de takım seçimi üç aşamada TÜBİTAK (Türkiye Bilimsel ve Teknik Araştırma Kurumu) tarafından yapılır.

Birinci Aşama Sınavı: Her yılın mayıs ayı içerisinde “Mayıs Sınavı” adı ile anılan çoktan seçmeli sorulardan oluşan bir sınav yapılır. Bu sınav sonunda Türkiye genelinde 20'si kamplı, 20'si kampsız 40 öğrenci ikinci aşama sınavına katılmaya hak kazanır. Kamplı olarak seçilen öğrenciler için ağustos ayında TÜBİTAK tarafından "Yaz Kampı" adıyla anılan ikinci aşama sınavına hazırlık kampı yapılır.
 

İkinci Aşama Sınavı: Her yılın aralık ayı içerisinde “Aralık Sınavı” adı ile anılan matematik ve biyoloji dallarında yazılı, fizik ve kimya dallarında yazılı ve uygulamalı, bilgisayar dalında ise uygulamalı bir sınav yapılır. Bu sınav sonunda Türkiye genelinde yaklaşık 10-12 öğrenci başarılı sayılır. (2 altın, 3-4 gümüş, 4-5 bronz madalya dağıtılır.) Bu sınavda başarılı olan tüm öğrenciler, şubat ayında, "Kış Kampı" adıyla anılan takım seçme sınavına hazırlık kampına katılır. Ayrıca üçüncü aşama sınavına katılmaya hak kazanan tüm öğrenciler katıldıkları ilk Üniversite Giriş Sınavları'nda bir seferlik olmak üzere aldıkları derece oranında ek katsayı uygulamasından yararlanırlar. (AOBP değerleri Ulusal Bilim Olimpiyatları'nda altın madalya kazananlar için 0.11, gümüş madalya kazananlar için 0.09, bronz madalya kazananlar için 0.07 ek katsayı ile çarpılır.)
 

Üçüncü Aşama Sınavı: Türkiye'yi yurtdışında temsil edecek takımın belirlendiği aşamadır. Bunun için bu sınava “Takım Seçme Sınavı” denir. Nisan ayında yapılan bu sınava, aralıktaki sınavda başarılı olan öğrenciler katılır. Bu sınavla belirlenen takımda yer bulan öğrencilere son bir kamp düzenlenir ve bu öğrenciler temmuz ayı içerisinde yapılan “Dünya Olimpiyat" sınavlarına katılarak, Türkiye'yi temsil eder. Ülkemizin TÜBİTAK'ın organizasyonu ile katıldığı Uluslararası Olimpiyatlar şunlardır: Uluslararası Bilgisayar Olimpiyatı (IOI), Uluslararası Matematik Olimpiyatı (IMO), Uluslararası Fizik Olimpiyatı (IPhO), Uluslararası Kimya Olimpiyatı (IChO), Uluslararası Biyoloji Olimpiyatı (IBO), Genç Balkan Matematik Olimpiyatı, Balkan Matematik Olimpiyatı ve Balkan Bilgisayar Olimpiyatı. Uluslararası Bilim Olimpiyatları'na katılan ancak derece alamayan öğrenciler 0.09 ek katsayı kazanmış olurlar. Yeni yapılan ve 2002 ÖSS'den itibaren geçerli olacak bir düzenleme ile Uluslararası Bilim Olimpiyatları'nda altın, gümüş ya da bronz madalya kazanan öğrenciler alanlarındaki yükseköğretim programlarından istediklerine sınavsız yerleştirileceklerdir.